基于無人機(jī)高光譜遙感的粳稻冠層葉綠素含量反演研究

題目

基于無人機(jī)高光譜遙感的粳稻冠層葉綠素含量反演研究

應(yīng)用關(guān)鍵詞

葉綠素含量；無人機(jī)高光譜；農(nóng)業(yè)應(yīng)用

背景

葉綠素含量是表征粳稻生長狀況的重要指標(biāo)。開發(fā)近地尺度的快速評估粳稻葉綠素含量的無人機(jī)高光譜遙感平臺，對輔助田間精準(zhǔn)施肥和農(nóng)藥施用具有重要現(xiàn)實意義。

目前，利用高光譜數(shù)據(jù)反演作物葉綠素的研究多采用統(tǒng)計回歸模型，大致可分為兩類：植被指數(shù)模型和直接光譜模型。在植被指數(shù)模型中，首先利用高光譜數(shù)據(jù)構(gòu)建各種植被指數(shù)，然后利用這些指數(shù)構(gòu)建多元線性或非線性回歸方法，建立這些指數(shù)與葉綠素含量之間的反演模型。這種方法的優(yōu)點是模型構(gòu)造簡單，物理意義明確。然而，它需要以特別的方式構(gòu)建大量的光譜指數(shù)，沒有對一般作物品種的系統(tǒng)指導(dǎo)。不同的光譜指數(shù)取決于特定物種的類型和區(qū)域，因此缺乏普遍適用性。直接光譜模型依賴于整個高光譜波段，通常是一個高維矢量。直接利用整個高光譜波段會導(dǎo)致模型復(fù)雜度高，甚至模型過擬合。這個問題可以通過采用降維技術(shù)，如主成分分析或偏最小二乘回歸來解決。

上述現(xiàn)有研究的高光譜數(shù)據(jù)大多是在地面或低空采集的。因此，測量的覆蓋面積非常小。本研究的無人機(jī)平臺可以在更高的高度操作，從而實現(xiàn)高效的大規(guī)模數(shù)據(jù)收集。具體來說，該系統(tǒng)工作在150 m的高度，可以在15秒內(nèi)獲得1000 m²區(qū)域的高光譜圖像。此外，文獻(xiàn)中的許多現(xiàn)有方法都是利用傳統(tǒng)的回歸方法開發(fā)的，其中許多模型參數(shù)是根據(jù)過去的經(jīng)驗進(jìn)行初始化。本研究采用數(shù)據(jù)驅(qū)動的方法，通過采集的數(shù)據(jù)進(jìn)行模型參數(shù)優(yōu)化。數(shù)據(jù)驅(qū)動的方法可以消除人為偏見，獲得更準(zhǔn)確的預(yù)測結(jié)果。

本研究的目的是利用無人機(jī)遙感平臺采集的高光譜成像數(shù)據(jù)，建立預(yù)測粳稻冠層葉綠素含量的反演模型。我們首先采用連續(xù)投影算法（Successive projection algorithm, SPA）從高光譜數(shù)據(jù)中提取特征波段。以提取的特征作為輸入，利用極限學(xué)習(xí)機(jī)（Extreme learning machine, ELM）建立反演模型。采用粒子群算法（Particle swarm optimization, PSO）對ELM的種群大小、慣性權(quán)重、學(xué)習(xí)因子、速度位置相關(guān)系數(shù)等參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化。最終構(gòu)建基于PSO-ELM算法的葉綠素含量高精度估測模型。

試驗設(shè)計

試驗地點位于遼中卡力瑪水稻實驗站，設(shè)有4個水稻氮肥梯度處理。沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)許童羽教授團(tuán)隊利用搭載有GaiaSky-mini2-VN高光譜相機(jī)（江蘇雙利合譜公司）的DJI M600無人機(jī)平臺（圖1），于粳稻分蘗、拔節(jié)、孕穗、抽穗、開花和灌漿期共6個關(guān)鍵生育期獲取其冠層高光譜影像。高光譜傳感器的波段范圍為400 ~ 1000 nm，光譜分辨率為2.35 nm。去除光譜上下邊界的兩個波段，最終得到253個有效波段。

圖1 無人機(jī)高光譜成像系統(tǒng)

本研究使用常見的連續(xù)投影算法SPA用于波段的選擇。本研究選擇的光譜范圍為400 ~ 800 nm，這是由于水稻葉綠素含量的變化主要影響該范圍內(nèi)的光譜反射率。SPA的輸出為波段的集合。為了進(jìn)一步減少波段數(shù)量，對所有輸出子集應(yīng)用多元線性回歸MLR模型，選擇產(chǎn)生最小均方根誤差RMSE的子集作為最終的優(yōu)選高光譜波段。

ELM是一種具有單層或多層隱層的前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。與傳統(tǒng)的反向傳播（BP）神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)不同，ELM隱層節(jié)點的參數(shù)是隨機(jī)分配的，而且永遠(yuǎn)不會調(diào)整。與傳統(tǒng)的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)相比，ELM的一個主要優(yōu)點是學(xué)習(xí)速度更快。然而，由于隱層節(jié)點參數(shù)的隨機(jī)性，在許多實際應(yīng)用中，通常需要大量的隱層節(jié)點才能達(dá)到預(yù)期的精度。此外，傳統(tǒng)的ELM架構(gòu)有時沒有很好的泛化能力。為了解決上述問題，我們提出采用粒子群限制學(xué)習(xí)機(jī)算法，即結(jié)合粒子群算法（PSO）和ELM。利用帶有粒子群優(yōu)化的ELM模擬了葉綠素含量與高光譜特征之間的關(guān)系。采用PSO對ELM的輸入層權(quán)值和隱層偏差進(jìn)行優(yōu)化選擇，計算輸出權(quán)重矩陣。本研究所考慮的粒子群算法參數(shù)主要包括群體大?。╬op）、慣性權(quán)重（w）、學(xué)習(xí)因子（C₁, C₂）和速度位置相關(guān)系數(shù)（m）。本文利用均方根誤差（RMSE）和決定系數(shù)（R²）對反演模型的精度進(jìn)行評價。

結(jié)論

首先，研究了粳稻葉綠素含量與不同高光譜波段的相關(guān)性。采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)、距離相關(guān)系數(shù)和最大信息系數(shù)（Maximum information coefficient, MIC）三種方法分析了葉綠素與各個波段的相關(guān)性（圖1）。這三種方法的結(jié)果總體上有相似的趨勢：葉綠素含量與高光譜反射率之間的最大相關(guān)性在波長范圍701 ~ 705 nm之間。具體而言，三種方法的相關(guān)系數(shù)峰分別為0.66、0.64和0.53。除了最大相關(guān)波段之外，在其他波段，如波長在410 ~ 480 nm之間的波段，也觀察到相對較強(qiáng)的相關(guān)性。雖然400至450 nm的反射率低于0.1，但所有波段的信噪比在6.0至15.9 dB之間，可以提取特征的響應(yīng)信息。

研究中利用SPA提取的特征波長分別為410 nm、481 nm、533 nm、702 nm和798 nm。702 nm和798 nm兩個波段與用于葉綠素含量反演指數(shù)使用的705 nm和750 nm波段基本一致。410 nm、481 nm和533 nm的特征波段與文獻(xiàn)中用于研究水稻拔節(jié)期的波段相似。綜合分析表明，不同的研究在特征波段的光譜區(qū)域選擇上存在重疊和差異。特征波段的差異主要是由于品種、生長期、環(huán)境條件和數(shù)據(jù)處理方法等方面的差異造成的，例如，（1）本研究所用的水稻品種與以往的研究不同；（2）稻田水分、雜草和土壤的存在可能影響高光譜信息。

利用從SPA中提取的波段的反射率作為自變量，以實測葉綠素含量作為因變量。采用粒子群算法PSO-ELM建立反演模型。為了比較，我們還測試了傳統(tǒng)ELM的反演結(jié)果。在PSO-ELM中，粒子群迭代次數(shù)為100次。由于粒子群優(yōu)化算法的參數(shù)很多，本研究設(shè)計了一個正交陣列來確定最佳的粒子群優(yōu)化參數(shù)。結(jié)果如表1所示，其中每個參數(shù)可以取5個值中的一個，并且共有5個參數(shù)。

圖1 單波段相關(guān)性分析

表1 PSO-ELM 正交陣列

表2總結(jié)了PSO-ELM參數(shù)的正交陣列結(jié)果，其中W_ij是從參數(shù)j的第i個值得到的R²之和。例如，W₁₁是通過計算第一個參數(shù)的第一個值對應(yīng)的R²之和得到的，pop = 40，而W₁₂是通過計算第二個參數(shù)的第一個值對應(yīng)的R²之和得到的，w = 0.3。具體計算公式如下所示。

每一列表明了一個參數(shù)對預(yù)測精度的影響。例如，在第一列中，對于i = 1，... ，5，W_i1之間的差異揭示了種群大小如何影響反演模型的準(zhǔn)確性，而與其他參數(shù)的值無關(guān)。由于W₂₁ ≥ W_i1，我們得出結(jié)論，最大化R²的種群大小應(yīng)該是正交陣列中的第二個值，也就是pop = 50。同樣，對應(yīng)于w、C₁、C₂和m的列分別在W₅₂、W₃₃、W₃₄和W₃₅處最大化。因此，參數(shù)的最佳值是pop = 50，w = 0.9 ~ 0.3，C₁ = 1.65，C₂ = 2.8和 m = 0.2。

表2 PSO-ELM正交陣列結(jié)果分析

通過正交陣列獲得的一組參數(shù)，我們可以得到PSO-ELM粳稻葉綠素含量反演模型。將新建立的反演模型應(yīng)用于實驗數(shù)據(jù)，得到R² = 0.791，RMSE = 8.215 mg/L。結(jié)果遠(yuǎn)優(yōu)于ELM模型，該模型的R² = 0.667，RMSE = 11.308 mg/L。反演結(jié)果表明，PSO-ELM模型對葉綠素含量的預(yù)測效果明顯優(yōu)于傳統(tǒng)ELM模型（圖2）。

圖2 粳稻冠層葉綠素含量反演結(jié)果

通過增加無人機(jī)平臺和地面數(shù)據(jù)的采集量，可以提高反演模型的精度。更多的數(shù)據(jù)可以減少由噪聲、干擾和不可避免的采集誤差引起的不確定性。此外，本研究只建立了供試粳稻品種的反演模型。為了提高模型的準(zhǔn)確性和普適性，今后的研究重點是增加試驗品種數(shù)量，建立不同生育期粳稻葉綠素含量反演模型。

UAV-HSI平臺能夠?qū)λ旧L信息進(jìn)行快速、準(zhǔn)確和無損評估。本文提出的方法可以及時了解水稻的生長狀況，這對于水稻施肥管理至關(guān)重要。不過，該方法面臨的一個挑戰(zhàn)是水稻葉片葉綠素含量隨水稻品種、肥力期、生長環(huán)境等因素不斷變化，所得結(jié)果僅適用于東北水稻，而其他水稻品種需要獲得新的模型參數(shù)。

作者信息

許童羽，博士，沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)信息與電氣工程學(xué)院教授，博士生導(dǎo)師。

主要研究方向：精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)航空、農(nóng)業(yè)信息化、農(nóng)業(yè)電氣化。

參考文獻(xiàn)：

Cao, Y.L., Jiang, K.L., Wu, J.X., Yu, F.H., Du, W., & Xu, T.Y. (2020). Inversion modeling of japonica rice canopy chlorophyll content with UAV hyperspectral remote sensing. PLoS One, 15(9):e0238530.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0238530